《精灵宝可梦》系列动画非常庞大，不同的系列有不同的剧情、主演等。
以下以最经典的无印篇为例进行介绍： 主演 小智：动画的核心主角，立志成为宝可梦大师，充满热情与冒险精神，带着皮卡丘踏上宝可梦之旅，不断成长和挑战各种道馆与比赛。
皮卡丘：小智形影不离的伙伴，拒绝待在精灵球里，拥有强大电力，性格活泼可爱，和小智建立了深厚的羁绊。
小霞：华蓝市道馆馆主之一，擅长水系宝可梦，性格直爽、脾气火爆，因皮卡丘弄坏她的脚踏车而跟随小智一起旅行。
小刚：尼比市道馆馆主，精通宝可梦培育知识，擅长岩石系宝可梦。
他细心体贴，常照顾同行伙伴，后离开队伍去追求宝可梦培育梦想。
无印篇剧情分集介绍 第1集：神奇宝贝，就决定是你了！ 真新镇的小智满十岁，领取初始宝可梦时迟到，只能选择皮卡丘。
皮卡丘一开始不听从小智指挥，但在遭受烈雀群攻击时，小智挺身而出保护皮卡丘，二者关系开始转变，踏上宝可梦之旅。
第2集：在神奇宝贝中心的决斗！ 小智一行来到常磐市宝可梦中心，遇到自称最强训练家的修夫。
修夫挑衅小智进行对战，皮卡丘轻松战胜修夫的拉达，让小智对皮卡丘的实力有了信心。
第3集：终于捉到神奇宝贝了！ 在森林中小智遇到野生绿毛虫，想收服它却状况百出。
最后绿毛虫进化成铁甲蛹，又进化成巴大蝴，小智成功收服巴大蝴，之后为了让巴大蝴追求爱情，小智选择放走它。
第4集：少年武士的挑战！ 少年武士用独角虫向小智发起对战挑战，声称自己的独角虫能打败任何宝可梦。
经过战斗，皮卡丘战胜独角虫，少年武士认识到自己的不足，决定继续修行。
第5集：尼比市的决斗！ 小智来到尼比市挑战小刚的道馆。
小刚派出小拳石和大岩蛇，皮卡丘因属性劣势陷入苦战。
后来小智利用场地环境，让皮卡丘借助铁球反弹攻击，成功战胜大岩蛇，获得灰色徽章。
第6集：皮皮与月亮石！ 小智等人在山上遇到一群皮皮举行神秘仪式。
火箭队出现抢走月亮石，引发皮皮愤怒。
最后在皮卡丘帮助下，小智等人夺回月亮石，皮皮们用月亮石的力量治愈了受伤的宝可梦。
第7集：华蓝市的水中花！ 小智一行抵达华蓝市，小霞回家发现姐姐们把道馆变成水上乐园。
小智挑战道馆，小霞派出宝石海星，皮卡丘因不适应水战失败。
之后小霞加入队伍，要求小智帮她修复脚踏车。
第8集：通向神奇宝贝擂台之路！ 小智参加宝可梦擂台赛，对手是阿弘。
比赛中皮卡丘被阿弘的比比鸟克制，关键时刻皮卡丘进化学会新技能十万伏特，战胜比比鸟，但最终小智因总分略低输掉比赛。
第9集：神奇宝贝必胜指南！ 小智等人遇到自称宝可梦博士的多武，多武给他们展示各种宝可梦知识卡片，但其实是个骗子，想用假卡片骗走皮卡丘。
最后小智识破骗局，多武落荒而逃。
第10集：神奇宝贝乡的妙蛙种子！ 在神奇宝贝乡，小智遇到妙蛙种子军团。
妙蛙种子不愿听从训练家指挥，小智通过和它沟通交流，成功收服妙蛙种子，妙蛙种子也认可了小智的领导。
第11集：走失的小火龙！ 小智发现一只被抛弃的小火龙，它在雨中瑟瑟发抖。
小智决定照顾小火龙并收服它，之后小火龙在与火箭队战斗中表现勇敢，逐渐成长。
第12集：杰尼龟军团登场！ 杰尼龟军团到处搞破坏，小智等人遇到后，小智通过战斗让杰尼龟军团认识到错误。
最后杰尼龟军团首领决定跟随小智，成为他的宝可梦。
第13集：正辉的灯塔！ 小智一行来到正辉的灯塔，正辉因思念远方的朋友而制造机器。
火箭队捣乱破坏机器，小智等人帮忙修复，最后正辉通过机器与远方朋友取得联系。
第14集：电击大对决！ 小智参加宝可梦电属性对战大赛，遇到劲敌雷电球训练家。
比赛中皮卡丘发挥出色，战胜多个对手，但在决赛中因体力不支输给雷电球，不过小智收获了宝贵经验。
第15集：超级油轮的战斗！ 小智等人登上超级油轮，在船上遇到富家子弟阿义。
阿义向小智发起对战挑战，派出卡蒂狗。
皮卡丘战胜卡蒂狗后，火箭队在船上捣乱，引发混乱，小智等人帮忙平息事端。
第16集：海上漂流记！ 油轮故障，小智等人乘坐救生艇漂流到荒岛。
在荒岛上他们遇到各种困难，还遭遇野生宝可梦袭击。
最后在大家共同努力下，成功发出求救信号，被路过船只救走。
第17集：荒岛历险记！ 接上集，在等待救援过程中，小智等人在荒岛探索，发现神秘遗迹。
火箭队也来到荒岛，企图抢夺遗迹中的宝物。
双方展开争夺，最后遗迹因地震即将崩塌，大家逃离荒岛。
第18集：清保高见的假期！ 小智等人来到度假胜地，遇到清保高见一家。
清保高见的孩子想和小智对战宝可梦，小智派出妙蛙种子获胜。
期间火箭队捣乱，破坏度假氛围，最后被小智等人赶走。
第19集：巨大神奇宝贝之岛！ 小智一行来到一座有巨大宝可梦的岛屿。
他们遇到巨大的卡比兽，火箭队想捕捉卡比兽，引发混乱。
小智等人帮助卡比兽摆脱火箭队控制，卡比兽也恢复平静。
第20集：迷唇姐的圣诞节！ 圣诞节前夕，小智等人在旅途中遇到迷唇姐。
迷唇姐喜欢上小智，一直跟着他。
火箭队趁机抓走迷唇姐，想利用它赚钱。
小智等人救出迷唇姐，一起度过了一个特别的圣诞节。
第21集：巴大蝴再见！ 小智等人再次遇到之前放走的巴大蝴，它带着伴侣和孩子。
巴大蝴邀请小智一起玩耍，之后为了保护家人和小智等人，巴大蝴与火箭队战斗。
最后小智看着巴大蝴一家远去，再次告别。
第22集：凯西，超能力大决斗！ 小智遇到凯西，想收服它却很难成功，因为凯西能瞬间移动。
后来在与火箭队战斗中，凯西帮助小智等人，小智趁机收服凯西。
之后遇到超能力者莉佳，她用超能力宝可梦对战小智。
第23集：在神奇宝贝塔收服幽灵！ 小智等人来到神奇宝贝塔，这里传说有幽灵出没。
小智在塔中遇到鬼斯，经过一番波折成功收服鬼斯。
火箭队在塔中捣乱，引发幽灵不满，最后被幽灵教训。
第24集：鬼斯通对抗超能力！ 小智带着鬼斯通挑战莉佳的道馆。
莉佳派出吸盘魔偶，鬼