《神奇宝贝》（又名《宝可梦》 ）动画系列非常庞大，不同版本有着各自独立又相互关联的故事线，以下以最经典的无印篇为例为你介绍： 主演 小智：立志成为神奇宝贝大师的热血少年，带着皮卡丘踏上冒险之旅，性格开朗、勇敢，充满正义感，不断在旅途中成长。
小霞：华蓝市道馆馆主，擅长水系神奇宝贝，性格直爽、脾气火爆，但心地善良，陪伴小智一同旅行。
小刚：尼比市道馆馆主，精通神奇宝贝培育知识，成熟稳重，负责照顾旅行中的众人饮食起居，也加入了小智的旅程。
剧情分集介绍 第1集：神奇宝贝，就决定是你了！ 真新镇的十岁少年小智，终于迎来了领取初始神奇宝贝的日子。
然而他睡过头，只剩下一只脾气倔强的皮卡丘。
小智带着皮卡丘踏上旅程，在常磐森林遭遇野生烈雀群袭击，皮卡丘展现强大实力击退烈雀，小智和皮卡丘的羁绊就此开始。
第2集：在神奇宝贝中心的决斗！ 小智和皮卡丘来到神奇宝贝中心，在这里遇到了同样来治疗神奇宝贝的训练家武藏和小次郎，他们隶属于火箭队。
火箭队企图偷走皮卡丘，引发了一场战斗，最终小智和皮卡丘成功击退火箭队。
第3集：终于捉到神奇宝贝了！ 小智在河边遇到杰尼龟，想要收服它。
经过一番周折，小智成功收服杰尼龟，杰尼龟成为他队伍中的一员，之后他们继续朝着下一个道馆前进。
第4集：少年武士的挑战！ 在路上，小智遇到少年武士，武士要求和小智进行神奇宝贝对战，若小智输了就要把皮卡丘给他。
小智接受挑战，派出皮卡丘战胜了武士的独角虫，继续旅程。
第5集：尼比市的决斗！ 小智一行来到尼比市，挑战尼比道馆。
道馆馆主小刚擅长岩石系神奇宝贝，小智派出杰尼龟和皮卡丘，经过艰难战斗，皮卡丘打败小刚的小拳石，小智获得灰色徽章。
第6集：皮皮与月亮石 夜晚，小智等人在山上休息时遇到一群皮皮。
火箭队出现抢夺月亮石，皮皮们合力对抗火箭队，最后在月亮石光芒照耀下进化成皮可西，小智等人离开继续旅程。
第7集：华蓝市的水中花 小智一行抵达华蓝市，这里的道馆馆主正是小霞。
小霞因之前小智弄坏她的脚踏车而要求赔偿，小智答应打赢道馆赛就赔偿，于是挑战开始，小霞派出宝石海星，小智的神奇宝贝接连战败。
第8集：通向神奇宝贝大赛之路 小智得知可以通过参加神奇宝贝大赛获得奖品来赔偿小霞的脚踏车，便报名参赛。
比赛中，小智凭借皮卡丘等神奇宝贝的努力，一路过关斩将，但最终还是遗憾落败。
第9集：神奇宝贝必胜指南 在旅行中，小智遇到一位自称神奇宝贝专家的老人，老人传授小智一些神奇宝贝对战技巧和知识，小智受益匪浅，继续朝着下一个道馆进发。
第10集：猜不到有意外收获 小智等人在森林里迷路，意外发现一个隐藏的神奇宝贝村落。
在这里他们了解到这个村落的秘密，还帮助村民解决了火箭队的骚扰问题，之后离开村落继续旅程。
第11集：失去主人的小火龙 小智在路边发现一只被主人抛弃的小火龙，心生怜悯决定收留它。
小火龙加入队伍后，和大家一起面对各种挑战。
第12集：杰尼龟军团登场！ 杰尼龟遇到一群同样喜欢捣蛋的杰尼龟组成的军团。
火箭队企图利用杰尼龟军团制造混乱，小智和杰尼龟军团合作，打败火箭队，杰尼龟军团也有所改变。
第13集：正辉的灯塔 小智等人来到一座灯塔，结识了灯塔管理员正辉。
正辉一直在寻找一只特殊的神奇宝贝——拉普拉斯。
小智等人帮助正辉找到了拉普拉斯，之后继续旅程。
第14集：电击大对决 小智一行遇到另一位训练家，对方想用自己的雷丘和小智的皮卡丘对战。
这场电系神奇宝贝的对决十分激烈，最终皮卡丘凭借顽强意志获胜。
第15集：超级油轮上的战斗 小智等人搭乘超级油轮旅行，在船上遇到火箭队搞破坏。
小智和伙伴们与火箭队展开战斗，同时还参加了船上举办的神奇宝贝对战比赛，最终成功解决危机并离开油轮。
第16集：海上漂流记 油轮遭遇暴风雨，小智等人不幸落水漂流到一个荒岛上。
在荒岛上，他们克服重重困难，寻找离开的方法，期间还收服了一些新的神奇宝贝。
第17集：荒岛历险记 在荒岛上，小智等人遇到各种危险，包括野生神奇宝贝的攻击和恶劣的自然环境。
但他们凭借彼此的信任和努力，一次次化险为夷，最终等到救援离开荒岛。
第18集：清保高见的假期 小智等人来到一个度假胜地，在这里遇到了清保高见。
清保高见邀请小智等人参加他组织的神奇宝贝活动，然而火箭队又来捣乱，小智等人再次击退火箭队。
第19集：巨大神奇宝贝之岛 他们来到一座神秘岛屿，岛上有许多巨大的神奇宝贝。
小智等人探索岛屿过程中，发现火箭队企图捕捉这些巨大神奇宝贝，小智和伙伴们阻止了火箭队的阴谋。
第20集：迷你龙的传说 在旅行中，小智等人听闻迷你龙的传说。
他们四处寻找迷你龙，最终真的遇到了迷你龙。
火箭队也想抢夺迷你龙，小智等人保护迷你龙，迷你龙安全离开，小智等人继续踏上新的旅程。
无印篇大结局 小智在经历了漫长的旅行和无数次战斗后，挑战了多个道馆，收集了一定数量的徽章。
虽然没有最终成为神奇宝贝大师，但他在这段旅程中收获了成长，和皮卡丘以及其他神奇宝贝建立了深厚感情，也和小霞、小刚结下了坚固的友谊。
他带着满满的回忆和经验，朝着成为神奇宝贝大师的梦想继续前行，未来还有更多未知的冒险等待着他。
需要注意的是，《神奇宝贝》动画后续还有多个系列篇章，每个篇章都有新的故事和角色加入，不断丰富着整个宝可梦的世界观和剧情内容。