《名侦探柯南》是一部长篇连载的动漫作品，截至2025年3月仍在持续更新中，所以并没有官方确定的大结局。
以下为你介绍主要角色及部分经典剧集剧情： 主演（主要角色） 江户川柯南：本作主角。
真实身份是高中生侦探工藤新一，在被黑衣组织灌下APTX4869后身体缩小，化名为江户川柯南，寄住在毛利兰家中，继续追踪黑衣组织。
毛利兰：女主角，工藤新一的青梅竹马，空手道高手，性格温柔又坚强，父亲是私家侦探毛利小五郎。
毛利小五郎：小兰的父亲，曾经是警察，后成为私家侦探。
表面上糊涂、好色，但在涉及家人等关键时刻会展现出不凡的推理能力。
灰原哀：原名宫野志保，曾是黑衣组织成员，代号“雪莉”，因反抗组织被囚禁，服下APTX4869后身体缩小，背叛组织后化名灰原哀，与柯南等人一起上学，协助柯南调查黑衣组织。
服部平次：关西的高中生侦探，剑道高手，与工藤新一齐名，知晓柯南的真实身份，经常与柯南一起破案，和远山和叶是青梅竹马。
怪盗基德（黑羽快斗）：一个充满传奇色彩的怪盗，精通易容、变声、逃脱术，经常盗窃名贵宝石，与柯南多次交锋，亦敌亦友。
部分剧集剧情介绍 云霄飞车杀人事件（第1集） 高中生侦探工藤新一和青梅竹马毛利兰一同去游乐园玩时，在乘坐云霄飞车时遭遇了一起命案。
新一通过细致观察和推理，迅速找出了凶手。
然而，在案件结束后，新一无意间目睹了黑衣组织成员的可疑交易，被琴酒打晕并灌下了尚未完成的毒药APTX4869，身体因此缩小成了小孩模样。
外交官杀人事件（第48 - 49集） 服部平次听闻工藤新一的大名，来到东京想与之一较高下。
此时恰好有一起外交官杀人案件，平次和柯南都参与其中。
平次一开始认为自己找到了真相并进行推理，但柯南因为感冒身体不适，在喝了服部带来的白干酒后恢复成工藤新一，指出了平次推理中的错误，并揭示了真正的凶手和作案手法。
这一集也是服部平次首次登场，并且知道了柯南就是工藤新一。
福尔摩斯迷杀人事件（第57 - 58集） 一群福尔摩斯迷聚集在一座山庄参加活动，期间发生了连续杀人事件。
服部平次和柯南等人被困在山庄内，凶手利用复杂的手法制造不在场证明。
在调查过程中，柯南和平次相互配合，最后柯南借助麻醉针让平次沉睡，以平次的声音揭露了凶手的作案手法和动机。
黑暗组织10亿元抢劫事件（第128集） 讲述了宫野明美（灰原哀的姐姐）为了让妹妹脱离黑衣组织，按照组织要求策划了10亿元抢劫案。
但完成任务后，她仍被琴酒杀害。
柯南在调查这起案件过程中，逐渐发现了黑衣组织更多的线索，也为之后灰原哀的登场埋下伏笔。
来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件（第129集） 灰原哀首次登场。
转学至帝丹小学的灰原引起了柯南的注意，与此同时，学校附近发生了一起大学教授被杀案件。
灰原在案件调查过程中展现出非凡的冷静和智慧，之后她向柯南坦白了自己的真实身份——黑衣组织成员宫野志保，以及自己服药变小的经过，并告知柯南APTX4869药物可能存在其他秘密。
与黑衣组织的再会（第176 - 178集） 灰原哀意外被黑衣组织成员发现，琴酒等人设计引她现身。
柯南发现灰原失踪后，四处寻找并推测出她可能落入了黑衣组织的陷阱。
在调查过程中，柯南通过一系列线索找到了灰原所在之处。
灰原在被琴酒枪击受伤后，柯南及时赶到救了她。
最后，柯南利用阿笠博士发明的工具，成功摆脱了黑衣组织的追击，同时也让灰原意识到黑衣组织对她的追杀不会停止。
危命的复活系列（第188 - 193集） 柯南在追捕犯人时，为保护小兰受伤，急需输血。
小兰恰好回忆起新一曾说过自己的血型，这让柯南担心小兰会发现自己的身份。
之后，灰原哀研制出临时解药，柯南变回工藤新一参加学园祭的话剧表演，并与小兰短暂相聚。
然而，药效即将到期时，新一在小兰面前又要变回柯南，关键时刻，灰原哀出现用麻醉针让小兰睡着，化解了危机。
震动警视厅 1200万名人质（第304集） 炸弹狂魔连续在东京多地放置炸弹，并留下暗号挑衅警方。
佐藤警官和高木警官等人全力调查，柯南也参与其中。
在破解炸弹位置的过程中，警方发现炸弹狂魔与三年前的一起案件有关，当时松田阵平警官为了获取下一个炸弹地点的提示，英勇牺牲。
此次炸弹狂魔故技重施，柯南和警方争分夺秒，最终成功拆除炸弹，阻止了悲剧的发生。
这一集佐藤警官也对高木警官的感情有了进一步发展。
满月之夜的双重谜案（第345集） 这是一场精彩绝伦的对决。
黑衣组织的贝尔摩德策划了一场阴谋，邀请了众多人物来到一艘船上。
柯南早就察觉到贝尔摩德的行动，提前做了准备。
与此同时，茱蒂老师等FBI探员也参与其中。
在船上，发生了多起神秘事件，各方势力错综复杂。
最后柯南和赤井秀一等联手，挫败了贝尔摩德的阴谋，贝尔摩德虽然知晓柯南就是工藤新一，但出于某些原因没有向组织汇报。
红与黑的碰撞系列（第491 - 504集） 本系列围绕着柯南、FBI与黑衣组织之间的激烈对抗展开。
水无怜奈（代号基尔）受伤昏迷后被FBI藏起来保护，黑衣组织为了找回她展开行动。
双方在医院等地展开了一系列智谋较量。
期间，赤井秀一为了让水无怜奈重新取得黑衣组织信任，上演了一场假死戏码，成功骗过了琴酒等人，为后续的暗中调查奠定基础。